阴茎流脓是霉菌性龟头炎，患病的部位出现红斑、肿胀、发热、溃烂、渗出，严重时可出现水疱、脓疱，阴茎流脓，患者会感觉灼热、疼痛，感染严重时患者会有发热、全身无力等不适。如果男性霉菌感染性龟头炎长时间不愈，龟头和包皮会粘连，形成继发性的包茎，导致尿道外口狭窄。
其次滴虫感染也会造成阴茎流脓。多因配偶患有阴道滴虫病而被传染。症状较轻，主要表现为龟头部起红斑丘疹、小水疱等。境界清楚、范围逐渐扩大，患者常感瘙痒。分泌物中可找到滴虫。此外，还有一些龟头炎病因不明确，但包皮过长，包皮垢刺激多与龟头炎的发生有关。故男性也应经常清洗下身，保持局部清洁、避免刺激，出现阴茎流脓要及时治疗。
并且阴茎流脓会造成生殖系统的感染，造成霉菌性尿道炎或者霉菌性龟头炎。男性霉菌的治疗主要就是针对这两种疾病.霉菌性龟头炎，多好发于20～50岁之间的青壮年，由于青壮年皮脂腺分泌旺盛，阴茎流脓，外阴潮湿，加之穿较厚的内裤或外阴清洁不够，男性霉菌的治疗的同时要养成一种健康的生活方法。这样才能彻底消除男性霉菌。
梅毒也会引起阴茎流脓，是在下疳形成之后才会在龟头上出现白色融合的表面且龟头会呈现水肿，它与一般感染性包皮龟头炎，整个龟头呈现红肿，有臭味及分泌物并不相同，判断是因梅毒螺旋体引发，则可以作血液检验查查看梅毒血清反应及凝集试验，来区别是梅毒或一般细菌或其它感染性的包皮龟头炎。
