逆行射精也有器质性的原因，可发生于某些手术后或长时间服用某些药物以后，也有部分病例是由于全身或局部性疾病所致。常见的逆行射精器质性病因如下：
（1）手术：前列腺增生经尿道电切后，造成的膀航颈部括约肌撕裂、神经损伤，以致括约肌关闭不全。直肠癌或前列腺癌经会阴手术后，由于支配膀胱颈部神经不可避免地受到一定损伤，以致膀优颈部在射精时不能同步收缩。
（2）药物：应用肾上腺素能阻滞剂，如利血平、胍乙啶、溴苄胺等。
（3）神经功能异常：双侧腰交感神经切除术后，导致支配膀跳颈部的神经功能异常。
（4）糖尿病：胰岛素依赖型糖尿病引起的阴部神经损害，以致膀胱颈部功能失调，关闭机能减弱，射精时不能同步收缩。
（5）尿道狭窄：某些疾病损伤引起尿道极度狭窄，射精时精液前行受阻，以致逆流入膀胱。
